בור הרג המוני

זהו בור ההרג השמור והעמוק ביותר. קוטרו 29 מטר, ובו מופיע בבירור מבנה הסוללות ופתחי הירי. הבור מוקף ברחבה אשר כולה היתה מכוסה עץ ועליה היו מסתדרים אנשי יחידת וילנה המיוחדת של ה-SD. ליד הכניסה לבור, בסוללות שבשני הצדדים, הוכנו גם עמדות עגולות המספיקות לאדם אחד – אלה כנראה היו עמדות שמירה, שם הוצבו שומרים הצופים במצב ומוכנים לרות בקורבנות במידה ויתחילו לברוח.
בעת שיקומו האדריכלי של אתר ההנצחה בפונאר בשנת 1985 לפי הפרוייקט הסובייטי, הוצבה פה אבן זיכרון עם כתובת בליטאית ורוסית, המודיעה כי “כאן נשרפו גופות שהוצאו ממקומות ההרג”. הכיתוב אינו מדוייק מכיוון שהגופות שהוצאו לא נשרפו בבורות עצמם, אלא הועלו ונשרפו במוקדים בגובה 4-5 מטר לצד הבורות. אפרם של הגופות נשפך בחזרה אל הבור או עורבב עם חול ליד הבור.