Masinių žudynių duobė
Ši 28 m skersmens šaudymo duobė savo struktūra primena greta esančią duobę. Rytiniame šios duobės šlaite, prie įėjimo į duobę, matyti specialiai įrengta aikštelė mažoms aukų grupėms šaudyti. Aikštelės struktūra analogiška šalia esančiai duobei. Aikštelė ratu juosia visą duobę, iš visų pusių prie jos veda angos pylime, pro kurias, kaip manoma, šaudydavo SD Vilniaus Ypatingojo būrio nariai. Kaip ir greta esančios duobės, šios duobės kraštai pietvakarių pusėje buvo nežymiai apgadinti XX a. 6 deš. greta tiesiant geležinkelį.
Įgyvendinant Panerių memorialo teritorijos architektūrinio sutvarkymo projektą, 1985 m. šioje duobėje buvo pastatytas akmeninis informacinis ženklas su įrašu lietuvių ir rusų kalbomis, informuojantis, jog „čia buvo deginami iš žudynių vietų iškasti lavonai“. Įrašas nėra tikslus, nes ekshumuoti aukų kūnai duobėse nebuvo deginami, bet iškeliami ir kraunami į 4–5 m aukščio laužus šalia duobių. Vėliau pelenai buvo suberiami atgal į duobę arba šalia duobių sumaišomi su smėliu. Pastarųjų metų neinvaziniai geofizikiniai tyrimai rodo, kad prie šios duobės laužaviečių nebuvo.